Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Pprc1Q6NZN1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Pprc1Q6NZN1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Pprc1Q6NZN1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Pprc1Q6NZN1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Pprc1Q6NZN1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Pprc1Q6NZN1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Pprc1Q6NZN1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Pprc1Q6NZN1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Pprc1Q6NZN1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Pprc1Q6NZN1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Pprc1Q6NZN1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Pprc1Q6NZN1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Pprc1Q6NZN1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Pprc1Q6NZN1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Pprc1Q6NZN1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Pprc1Q6NZN1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Pprc1Q6NZN1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Pprc1Q6NZN1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Pprc1Q6NZN1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Pprc1Q6NZN1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Pprc1Q6NZN1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Pprc1Q6NZN1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Pprc1Q6NZN1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Pprc1Q6NZN1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Pprc1Q6NZN1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Pprc1Q6NZN1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Pprc1Q6NZN1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Pprc1Q6NZN1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Pprc1Q6NZN1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Pprc1Q6NZN1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Pprc1Q6NZN1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Pprc1Q6NZN1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Pprc1Q6NZN1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Pprc1Q6NZN1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Pprc1Q6NZN1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Pprc1Q6NZN1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Pprc1Q6NZN1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Pprc1Q6NZN1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Pprc1Q6NZN1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Pprc1Q6NZN1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Pprc1Q6NZN1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Pprc1Q6NZN1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Pprc1Q6NZN1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Pprc1Q6NZN1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Pprc1Q6NZN1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Pprc1Q6NZN1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Pprc1Q6NZN1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Pprc1Q6NZN1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Pprc1Q6NZN1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Pprc1Q6NZN1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Pprc1Q6NZN1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Pprc1Q6NZN1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Pprc1Q6NZN1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Pprc1Q6NZN1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Pprc1Q6NZN1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Pprc1Q6NZN1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Pprc1Q6NZN1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Pprc1Q6NZN1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Pprc1Q6NZN1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Pprc1Q6NZN1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Pprc1Q6NZN1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Pprc1Q6NZN1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Pprc1Q6NZN1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Pprc1Q6NZN1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Pprc1Q6NZN1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Pprc1Q6NZN1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Pprc1Q6NZN1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Pprc1Q6NZN1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Pprc1Q6NZN1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Pprc1Q6NZN1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Pprc1Q6NZN1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Pprc1Q6NZN1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Pprc1Q6NZN1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Pprc1Q6NZN1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Pprc1Q6NZN1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Pprc1Q6NZN1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Pprc1Q6NZN1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Pprc1Q6NZN1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Pprc1Q6NZN1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Pprc1Q6NZN1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Pprc1Q6NZN1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Pprc1Q6NZN1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Pprc1Q6NZN1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Pprc1Q6NZN1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Pprc1Q6NZN1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Pprc1Q6NZN1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Pprc1Q6NZN1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Pprc1Q6NZN1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Pprc1Q6NZN1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Pprc1Q6NZN1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Pprc1Q6NZN1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Pprc1Q6NZN1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Pprc1Q6NZN1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Pprc1Q6NZN1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Pprc1Q6NZN1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Pprc1Q6NZN1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Pprc1Q6NZN1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Pprc1Q6NZN1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Pprc1Q6NZN1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms