Protein–RNA interactions for Protein: Q6JPI3

Med13l, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, mousemouse

Predictions only

Length 2,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13lQ6JPI3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Med13lQ6JPI3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med13lQ6JPI3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med13lQ6JPI3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med13lQ6JPI3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med13lQ6JPI3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med13lQ6JPI3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med13lQ6JPI3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med13lQ6JPI3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med13lQ6JPI3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med13lQ6JPI3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Med13lQ6JPI3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med13lQ6JPI3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med13lQ6JPI3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med13lQ6JPI3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med13lQ6JPI3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Med13lQ6JPI3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Med13lQ6JPI3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Med13lQ6JPI3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med13lQ6JPI3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Med13lQ6JPI3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Med13lQ6JPI3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Med13lQ6JPI3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med13lQ6JPI3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med13lQ6JPI3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med13lQ6JPI3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med13lQ6JPI3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med13lQ6JPI3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med13lQ6JPI3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med13lQ6JPI3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med13lQ6JPI3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med13lQ6JPI3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med13lQ6JPI3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med13lQ6JPI3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med13lQ6JPI3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med13lQ6JPI3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Med13lQ6JPI3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med13lQ6JPI3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Med13lQ6JPI3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med13lQ6JPI3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med13lQ6JPI3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med13lQ6JPI3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med13lQ6JPI3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med13lQ6JPI3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med13lQ6JPI3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med13lQ6JPI3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med13lQ6JPI3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med13lQ6JPI3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Med13lQ6JPI3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Med13lQ6JPI3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med13lQ6JPI3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med13lQ6JPI3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med13lQ6JPI3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med13lQ6JPI3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med13lQ6JPI3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med13lQ6JPI3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med13lQ6JPI3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med13lQ6JPI3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med13lQ6JPI3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med13lQ6JPI3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med13lQ6JPI3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med13lQ6JPI3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med13lQ6JPI3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med13lQ6JPI3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med13lQ6JPI3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med13lQ6JPI3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med13lQ6JPI3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Med13lQ6JPI3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med13lQ6JPI3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms