Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Sohlh1Q6IUP1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sohlh1Q6IUP1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sohlh1Q6IUP1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sohlh1Q6IUP1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sohlh1Q6IUP1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sohlh1Q6IUP1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sohlh1Q6IUP1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sohlh1Q6IUP1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sohlh1Q6IUP1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sohlh1Q6IUP1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sohlh1Q6IUP1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sohlh1Q6IUP1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sohlh1Q6IUP1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sohlh1Q6IUP1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sohlh1Q6IUP1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sohlh1Q6IUP1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sohlh1Q6IUP1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sohlh1Q6IUP1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sohlh1Q6IUP1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sohlh1Q6IUP1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sohlh1Q6IUP1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sohlh1Q6IUP1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sohlh1Q6IUP1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sohlh1Q6IUP1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sohlh1Q6IUP1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sohlh1Q6IUP1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sohlh1Q6IUP1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sohlh1Q6IUP1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sohlh1Q6IUP1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sohlh1Q6IUP1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sohlh1Q6IUP1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sohlh1Q6IUP1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sohlh1Q6IUP1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sohlh1Q6IUP1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sohlh1Q6IUP1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sohlh1Q6IUP1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sohlh1Q6IUP1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sohlh1Q6IUP1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sohlh1Q6IUP1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sohlh1Q6IUP1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sohlh1Q6IUP1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sohlh1Q6IUP1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sohlh1Q6IUP1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sohlh1Q6IUP1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sohlh1Q6IUP1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sohlh1Q6IUP1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sohlh1Q6IUP1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sohlh1Q6IUP1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sohlh1Q6IUP1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sohlh1Q6IUP1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sohlh1Q6IUP1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sohlh1Q6IUP1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sohlh1Q6IUP1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sohlh1Q6IUP1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sohlh1Q6IUP1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sohlh1Q6IUP1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sohlh1Q6IUP1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sohlh1Q6IUP1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sohlh1Q6IUP1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sohlh1Q6IUP1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sohlh1Q6IUP1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sohlh1Q6IUP1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sohlh1Q6IUP1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sohlh1Q6IUP1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sohlh1Q6IUP1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sohlh1Q6IUP1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sohlh1Q6IUP1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sohlh1Q6IUP1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sohlh1Q6IUP1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sohlh1Q6IUP1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms