Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Best3Q6H1V1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Best3Q6H1V1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Best3Q6H1V1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Best3Q6H1V1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Best3Q6H1V1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Best3Q6H1V1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Best3Q6H1V1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Best3Q6H1V1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Best3Q6H1V1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Best3Q6H1V1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Best3Q6H1V1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Best3Q6H1V1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Best3Q6H1V1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Best3Q6H1V1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Best3Q6H1V1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Best3Q6H1V1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Best3Q6H1V1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Best3Q6H1V1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Best3Q6H1V1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Best3Q6H1V1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Best3Q6H1V1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Best3Q6H1V1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Best3Q6H1V1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Best3Q6H1V1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Best3Q6H1V1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Best3Q6H1V1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Best3Q6H1V1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Best3Q6H1V1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Best3Q6H1V1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Best3Q6H1V1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Best3Q6H1V1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Best3Q6H1V1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Best3Q6H1V1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Best3Q6H1V1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Best3Q6H1V1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Best3Q6H1V1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Best3Q6H1V1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Best3Q6H1V1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Best3Q6H1V1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Best3Q6H1V1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Best3Q6H1V1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Best3Q6H1V1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Best3Q6H1V1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Best3Q6H1V1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Best3Q6H1V1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Best3Q6H1V1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Best3Q6H1V1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Best3Q6H1V1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Best3Q6H1V1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Best3Q6H1V1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Best3Q6H1V1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Best3Q6H1V1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Best3Q6H1V1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Best3Q6H1V1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Best3Q6H1V1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Best3Q6H1V1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Best3Q6H1V1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Best3Q6H1V1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Best3Q6H1V1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Best3Q6H1V1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Best3Q6H1V1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Best3Q6H1V1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Best3Q6H1V1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Best3Q6H1V1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Best3Q6H1V1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Best3Q6H1V1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Best3Q6H1V1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Best3Q6H1V1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Best3Q6H1V1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Best3Q6H1V1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Best3Q6H1V1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Best3Q6H1V1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Best3Q6H1V1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Best3Q6H1V1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Best3Q6H1V1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Best3Q6H1V1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Best3Q6H1V1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Best3Q6H1V1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Best3Q6H1V1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Best3Q6H1V1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Best3Q6H1V1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Best3Q6H1V1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Best3Q6H1V1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Best3Q6H1V1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Best3Q6H1V1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Best3Q6H1V1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Best3Q6H1V1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Best3Q6H1V1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Best3Q6H1V1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Best3Q6H1V1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Best3Q6H1V1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Best3Q6H1V1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Best3Q6H1V1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Best3Q6H1V1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Best3Q6H1V1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Best3Q6H1V1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Best3Q6H1V1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Best3Q6H1V1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Best3Q6H1V1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms