Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdc3Q64519 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sdc3Q64519 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdc3Q64519 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms