Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprdQ64487 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprdQ64487 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprdQ64487 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprdQ64487 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprdQ64487 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprdQ64487 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprdQ64487 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprdQ64487 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprdQ64487 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprdQ64487 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprdQ64487 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprdQ64487 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprdQ64487 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprdQ64487 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprdQ64487 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprdQ64487 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprdQ64487 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprdQ64487 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprdQ64487 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprdQ64487 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprdQ64487 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprdQ64487 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprdQ64487 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprdQ64487 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprdQ64487 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprdQ64487 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprdQ64487 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprdQ64487 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprdQ64487 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprdQ64487 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprdQ64487 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprdQ64487 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprdQ64487 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprdQ64487 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprdQ64487 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprdQ64487 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprdQ64487 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprdQ64487 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprdQ64487 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprdQ64487 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprdQ64487 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprdQ64487 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprdQ64487 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprdQ64487 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprdQ64487 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprdQ64487 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprdQ64487 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprdQ64487 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprdQ64487 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprdQ64487 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprdQ64487 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprdQ64487 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprdQ64487 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprdQ64487 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprdQ64487 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprdQ64487 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprdQ64487 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprdQ64487 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprdQ64487 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprdQ64487 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprdQ64487 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprdQ64487 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PtprdQ64487 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprdQ64487 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprdQ64487 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprdQ64487 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprdQ64487 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprdQ64487 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprdQ64487 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprdQ64487 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprdQ64487 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprdQ64487 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprdQ64487 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprdQ64487 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprdQ64487 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprdQ64487 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprdQ64487 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprdQ64487 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprdQ64487 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprdQ64487 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprdQ64487 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprdQ64487 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprdQ64487 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprdQ64487 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprdQ64487 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprdQ64487 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprdQ64487 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprdQ64487 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprdQ64487 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtprdQ64487 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprdQ64487 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprdQ64487 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprdQ64487 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprdQ64487 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprdQ64487 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprdQ64487 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprdQ64487 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprdQ64487 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprdQ64487 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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