Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gja3Q64448 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gja3Q64448 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gja3Q64448 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gja3Q64448 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gja3Q64448 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gja3Q64448 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Gja3Q64448 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gja3Q64448 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Gja3Q64448 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gja3Q64448 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gja3Q64448 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gja3Q64448 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gja3Q64448 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gja3Q64448 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gja3Q64448 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gja3Q64448 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gja3Q64448 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gja3Q64448 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gja3Q64448 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gja3Q64448 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Gja3Q64448 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gja3Q64448 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gja3Q64448 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gja3Q64448 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gja3Q64448 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gja3Q64448 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Gja3Q64448 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gja3Q64448 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gja3Q64448 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gja3Q64448 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gja3Q64448 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gja3Q64448 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gja3Q64448 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gja3Q64448 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Gja3Q64448 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gja3Q64448 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Gja3Q64448 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gja3Q64448 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gja3Q64448 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gja3Q64448 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gja3Q64448 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gja3Q64448 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gja3Q64448 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Gja3Q64448 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gja3Q64448 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gja3Q64448 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gja3Q64448 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gja3Q64448 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gja3Q64448 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Gja3Q64448 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gja3Q64448 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Gja3Q64448 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gja3Q64448 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gja3Q64448 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gja3Q64448 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gja3Q64448 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gja3Q64448 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Gja3Q64448 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gja3Q64448 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gja3Q64448 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gja3Q64448 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gja3Q64448 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gja3Q64448 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gja3Q64448 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gja3Q64448 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gja3Q64448 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms