Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ca4Q64444 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ca4Q64444 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ca4Q64444 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ca4Q64444 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ca4Q64444 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ca4Q64444 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ca4Q64444 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ca4Q64444 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ca4Q64444 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ca4Q64444 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ca4Q64444 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ca4Q64444 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ca4Q64444 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ca4Q64444 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ca4Q64444 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ca4Q64444 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ca4Q64444 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ca4Q64444 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ca4Q64444 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ca4Q64444 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ca4Q64444 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ca4Q64444 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ca4Q64444 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ca4Q64444 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ca4Q64444 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ca4Q64444 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms