Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssr4Q62186 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssr4Q62186 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssr4Q62186 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssr4Q62186 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssr4Q62186 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssr4Q62186 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssr4Q62186 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssr4Q62186 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssr4Q62186 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssr4Q62186 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssr4Q62186 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssr4Q62186 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssr4Q62186 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssr4Q62186 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssr4Q62186 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssr4Q62186 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssr4Q62186 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssr4Q62186 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssr4Q62186 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssr4Q62186 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssr4Q62186 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssr4Q62186 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssr4Q62186 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssr4Q62186 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssr4Q62186 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssr4Q62186 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssr4Q62186 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssr4Q62186 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssr4Q62186 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssr4Q62186 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssr4Q62186 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssr4Q62186 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssr4Q62186 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssr4Q62186 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssr4Q62186 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssr4Q62186 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssr4Q62186 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssr4Q62186 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssr4Q62186 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssr4Q62186 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssr4Q62186 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssr4Q62186 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssr4Q62186 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssr4Q62186 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssr4Q62186 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssr4Q62186 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssr4Q62186 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssr4Q62186 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssr4Q62186 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssr4Q62186 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssr4Q62186 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssr4Q62186 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssr4Q62186 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssr4Q62186 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssr4Q62186 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssr4Q62186 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssr4Q62186 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssr4Q62186 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ssr4Q62186 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ssr4Q62186 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ssr4Q62186 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ssr4Q62186 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ssr4Q62186 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ssr4Q62186 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ssr4Q62186 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssr4Q62186 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssr4Q62186 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssr4Q62186 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms