Protein–RNA interactions for Protein: Q62165

Dag1, Dystroglycan, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dag1Q62165 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dag1Q62165 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dag1Q62165 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dag1Q62165 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dag1Q62165 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dag1Q62165 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dag1Q62165 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dag1Q62165 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dag1Q62165 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Dag1Q62165 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dag1Q62165 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dag1Q62165 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dag1Q62165 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dag1Q62165 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dag1Q62165 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dag1Q62165 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dag1Q62165 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dag1Q62165 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dag1Q62165 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dag1Q62165 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dag1Q62165 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dag1Q62165 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dag1Q62165 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dag1Q62165 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dag1Q62165 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Dag1Q62165 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Dag1Q62165 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dag1Q62165 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dag1Q62165 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dag1Q62165 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dag1Q62165 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dag1Q62165 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dag1Q62165 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dag1Q62165 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dag1Q62165 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Dag1Q62165 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dag1Q62165 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dag1Q62165 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dag1Q62165 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dag1Q62165 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dag1Q62165 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dag1Q62165 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dag1Q62165 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dag1Q62165 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dag1Q62165 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dag1Q62165 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dag1Q62165 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dag1Q62165 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dag1Q62165 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Dag1Q62165 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dag1Q62165 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dag1Q62165 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dag1Q62165 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dag1Q62165 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dag1Q62165 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dag1Q62165 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Dag1Q62165 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dag1Q62165 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dag1Q62165 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dag1Q62165 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Dag1Q62165 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Dag1Q62165 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dag1Q62165 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dag1Q62165 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dag1Q62165 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Dag1Q62165 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dag1Q62165 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dag1Q62165 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dag1Q62165 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dag1Q62165 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dag1Q62165 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dag1Q62165 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dag1Q62165 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dag1Q62165 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dag1Q62165 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dag1Q62165 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dag1Q62165 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dag1Q62165 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dag1Q62165 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dag1Q62165 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dag1Q62165 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dag1Q62165 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dag1Q62165 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dag1Q62165 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dag1Q62165 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dag1Q62165 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dag1Q62165 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dag1Q62165 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dag1Q62165 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dag1Q62165 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dag1Q62165 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dag1Q62165 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dag1Q62165 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dag1Q62165 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dag1Q62165 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dag1Q62165 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dag1Q62165 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dag1Q62165 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dag1Q62165 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dag1Q62165 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms