Protein–RNA interactions for Protein: Q61967

Zfp90, Zinc finger protein 90, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp90Q61967 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zfp90Q61967 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zfp90Q61967 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zfp90Q61967 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zfp90Q61967 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zfp90Q61967 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zfp90Q61967 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zfp90Q61967 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zfp90Q61967 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zfp90Q61967 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zfp90Q61967 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zfp90Q61967 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp90Q61967 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp90Q61967 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp90Q61967 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp90Q61967 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zfp90Q61967 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zfp90Q61967 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Zfp90Q61967 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zfp90Q61967 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zfp90Q61967 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zfp90Q61967 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zfp90Q61967 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zfp90Q61967 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Zfp90Q61967 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zfp90Q61967 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zfp90Q61967 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zfp90Q61967 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zfp90Q61967 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zfp90Q61967 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zfp90Q61967 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zfp90Q61967 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Zfp90Q61967 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Zfp90Q61967 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zfp90Q61967 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfp90Q61967 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfp90Q61967 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfp90Q61967 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfp90Q61967 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfp90Q61967 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zfp90Q61967 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zfp90Q61967 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zfp90Q61967 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zfp90Q61967 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zfp90Q61967 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp90Q61967 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp90Q61967 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp90Q61967 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp90Q61967 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp90Q61967 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp90Q61967 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zfp90Q61967 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zfp90Q61967 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zfp90Q61967 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zfp90Q61967 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zfp90Q61967 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zfp90Q61967 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zfp90Q61967 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfp90Q61967 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfp90Q61967 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfp90Q61967 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfp90Q61967 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zfp90Q61967 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zfp90Q61967 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zfp90Q61967 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zfp90Q61967 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zfp90Q61967 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zfp90Q61967 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp90Q61967 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp90Q61967 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp90Q61967 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp90Q61967 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp90Q61967 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp90Q61967 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp90Q61967 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp90Q61967 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfp90Q61967 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfp90Q61967 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfp90Q61967 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfp90Q61967 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp90Q61967 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp90Q61967 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp90Q61967 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp90Q61967 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp90Q61967 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp90Q61967 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp90Q61967 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp90Q61967 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp90Q61967 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp90Q61967 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp90Q61967 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp90Q61967 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp90Q61967 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp90Q61967 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp90Q61967 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp90Q61967 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp90Q61967 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp90Q61967 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zfp90Q61967 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Zfp90Q61967 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms