Protein–RNA interactions for Protein: Q60952

Cep250, Centrosome-associated protein CEP250, mousemouse

Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep250Q60952 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cep250Q60952 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cep250Q60952 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cep250Q60952 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cep250Q60952 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cep250Q60952 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cep250Q60952 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cep250Q60952 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cep250Q60952 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cep250Q60952 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cep250Q60952 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cep250Q60952 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cep250Q60952 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cep250Q60952 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cep250Q60952 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cep250Q60952 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cep250Q60952 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cep250Q60952 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cep250Q60952 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cep250Q60952 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cep250Q60952 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cep250Q60952 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cep250Q60952 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cep250Q60952 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cep250Q60952 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cep250Q60952 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cep250Q60952 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cep250Q60952 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Cep250Q60952 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cep250Q60952 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cep250Q60952 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cep250Q60952 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cep250Q60952 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cep250Q60952 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cep250Q60952 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cep250Q60952 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cep250Q60952 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Cep250Q60952 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cep250Q60952 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cep250Q60952 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cep250Q60952 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cep250Q60952 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cep250Q60952 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cep250Q60952 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cep250Q60952 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cep250Q60952 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Cep250Q60952 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cep250Q60952 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cep250Q60952 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cep250Q60952 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cep250Q60952 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cep250Q60952 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cep250Q60952 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cep250Q60952 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cep250Q60952 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cep250Q60952 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cep250Q60952 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cep250Q60952 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cep250Q60952 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cep250Q60952 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cep250Q60952 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cep250Q60952 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cep250Q60952 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cep250Q60952 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cep250Q60952 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1110.5 ms