Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grik1Q60934 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grik1Q60934 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grik1Q60934 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grik1Q60934 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grik1Q60934 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik1Q60934 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik1Q60934 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik1Q60934 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik1Q60934 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grik1Q60934 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grik1Q60934 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grik1Q60934 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grik1Q60934 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grik1Q60934 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grik1Q60934 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Grik1Q60934 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Grik1Q60934 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Grik1Q60934 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Grik1Q60934 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grik1Q60934 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grik1Q60934 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grik1Q60934 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grik1Q60934 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grik1Q60934 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grik1Q60934 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grik1Q60934 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grik1Q60934 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grik1Q60934 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grik1Q60934 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grik1Q60934 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grik1Q60934 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Grik1Q60934 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grik1Q60934 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grik1Q60934 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik1Q60934 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grik1Q60934 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grik1Q60934 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grik1Q60934 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grik1Q60934 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grik1Q60934 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Grik1Q60934 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grik1Q60934 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grik1Q60934 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms