Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stxbp3Q60770 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Stxbp3Q60770 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stxbp3Q60770 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stxbp3Q60770 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stxbp3Q60770 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stxbp3Q60770 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stxbp3Q60770 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stxbp3Q60770 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stxbp3Q60770 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stxbp3Q60770 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stxbp3Q60770 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stxbp3Q60770 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stxbp3Q60770 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stxbp3Q60770 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stxbp3Q60770 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Stxbp3Q60770 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stxbp3Q60770 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stxbp3Q60770 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stxbp3Q60770 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stxbp3Q60770 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stxbp3Q60770 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stxbp3Q60770 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stxbp3Q60770 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stxbp3Q60770 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stxbp3Q60770 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stxbp3Q60770 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stxbp3Q60770 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stxbp3Q60770 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Stxbp3Q60770 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stxbp3Q60770 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stxbp3Q60770 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stxbp3Q60770 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stxbp3Q60770 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stxbp3Q60770 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stxbp3Q60770 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stxbp3Q60770 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stxbp3Q60770 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stxbp3Q60770 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stxbp3Q60770 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stxbp3Q60770 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stxbp3Q60770 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stxbp3Q60770 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stxbp3Q60770 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stxbp3Q60770 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stxbp3Q60770 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Stxbp3Q60770 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stxbp3Q60770 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stxbp3Q60770 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stxbp3Q60770 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stxbp3Q60770 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stxbp3Q60770 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stxbp3Q60770 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stxbp3Q60770 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stxbp3Q60770 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stxbp3Q60770 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stxbp3Q60770 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stxbp3Q60770 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stxbp3Q60770 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stxbp3Q60770 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stxbp3Q60770 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stxbp3Q60770 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stxbp3Q60770 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stxbp3Q60770 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stxbp3Q60770 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Stxbp3Q60770 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stxbp3Q60770 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stxbp3Q60770 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stxbp3Q60770 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stxbp3Q60770 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stxbp3Q60770 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms