Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE0

Mybpc2, Myosin-binding protein C, fast-type, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mybpc2Q5XKE0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mybpc2Q5XKE0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mybpc2Q5XKE0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Mybpc2Q5XKE0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Mybpc2Q5XKE0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mybpc2Q5XKE0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mybpc2Q5XKE0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mybpc2Q5XKE0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mybpc2Q5XKE0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mybpc2Q5XKE0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mybpc2Q5XKE0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mybpc2Q5XKE0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Mybpc2Q5XKE0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mybpc2Q5XKE0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mybpc2Q5XKE0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mybpc2Q5XKE0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mybpc2Q5XKE0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mybpc2Q5XKE0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mybpc2Q5XKE0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mybpc2Q5XKE0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mybpc2Q5XKE0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mybpc2Q5XKE0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mybpc2Q5XKE0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mybpc2Q5XKE0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mybpc2Q5XKE0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mybpc2Q5XKE0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mybpc2Q5XKE0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mybpc2Q5XKE0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mybpc2Q5XKE0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mybpc2Q5XKE0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mybpc2Q5XKE0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mybpc2Q5XKE0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mybpc2Q5XKE0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mybpc2Q5XKE0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mybpc2Q5XKE0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mybpc2Q5XKE0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mybpc2Q5XKE0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mybpc2Q5XKE0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mybpc2Q5XKE0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mybpc2Q5XKE0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mybpc2Q5XKE0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mybpc2Q5XKE0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Mybpc2Q5XKE0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mybpc2Q5XKE0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mybpc2Q5XKE0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mybpc2Q5XKE0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mybpc2Q5XKE0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mybpc2Q5XKE0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mybpc2Q5XKE0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mybpc2Q5XKE0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mybpc2Q5XKE0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mybpc2Q5XKE0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mybpc2Q5XKE0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mybpc2Q5XKE0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mybpc2Q5XKE0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mybpc2Q5XKE0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mybpc2Q5XKE0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mybpc2Q5XKE0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mybpc2Q5XKE0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Mybpc2Q5XKE0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mybpc2Q5XKE0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mybpc2Q5XKE0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mybpc2Q5XKE0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mybpc2Q5XKE0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mybpc2Q5XKE0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mybpc2Q5XKE0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mybpc2Q5XKE0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mybpc2Q5XKE0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mybpc2Q5XKE0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mybpc2Q5XKE0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mybpc2Q5XKE0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mybpc2Q5XKE0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mybpc2Q5XKE0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mybpc2Q5XKE0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mybpc2Q5XKE0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mybpc2Q5XKE0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mybpc2Q5XKE0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Mybpc2Q5XKE0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mybpc2Q5XKE0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mybpc2Q5XKE0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mybpc2Q5XKE0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mybpc2Q5XKE0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Mybpc2Q5XKE0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mybpc2Q5XKE0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Mybpc2Q5XKE0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mybpc2Q5XKE0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Mybpc2Q5XKE0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms