Protein–RNA interactions for Protein: Q5F201

Cfap52, Cilia- and flagella-associated protein 52, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap52Q5F201 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cfap52Q5F201 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cfap52Q5F201 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cfap52Q5F201 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cfap52Q5F201 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cfap52Q5F201 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cfap52Q5F201 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cfap52Q5F201 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfap52Q5F201 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfap52Q5F201 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfap52Q5F201 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfap52Q5F201 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cfap52Q5F201 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cfap52Q5F201 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cfap52Q5F201 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap52Q5F201 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap52Q5F201 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap52Q5F201 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap52Q5F201 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap52Q5F201 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap52Q5F201 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap52Q5F201 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap52Q5F201 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cfap52Q5F201 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cfap52Q5F201 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cfap52Q5F201 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfap52Q5F201 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfap52Q5F201 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfap52Q5F201 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfap52Q5F201 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfap52Q5F201 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfap52Q5F201 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfap52Q5F201 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap52Q5F201 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap52Q5F201 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap52Q5F201 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap52Q5F201 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap52Q5F201 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap52Q5F201 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap52Q5F201 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap52Q5F201 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap52Q5F201 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap52Q5F201 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap52Q5F201 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap52Q5F201 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap52Q5F201 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfap52Q5F201 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfap52Q5F201 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfap52Q5F201 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfap52Q5F201 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfap52Q5F201 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfap52Q5F201 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cfap52Q5F201 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cfap52Q5F201 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cfap52Q5F201 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cfap52Q5F201 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfap52Q5F201 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfap52Q5F201 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfap52Q5F201 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfap52Q5F201 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap52Q5F201 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap52Q5F201 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap52Q5F201 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap52Q5F201 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap52Q5F201 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap52Q5F201 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap52Q5F201 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap52Q5F201 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfap52Q5F201 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfap52Q5F201 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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