Protein–RNA interactions for Protein: Q52KH6

Gm14685, DNA segment, Chr X, Baylor 18, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm14685Q52KH6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm14685Q52KH6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gm14685Q52KH6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm14685Q52KH6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm14685Q52KH6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm14685Q52KH6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm14685Q52KH6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm14685Q52KH6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm14685Q52KH6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm14685Q52KH6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm14685Q52KH6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm14685Q52KH6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm14685Q52KH6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm14685Q52KH6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm14685Q52KH6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm14685Q52KH6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm14685Q52KH6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm14685Q52KH6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm14685Q52KH6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm14685Q52KH6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm14685Q52KH6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm14685Q52KH6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm14685Q52KH6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm14685Q52KH6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm14685Q52KH6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm14685Q52KH6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Gm14685Q52KH6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Gm14685Q52KH6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm14685Q52KH6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm14685Q52KH6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm14685Q52KH6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm14685Q52KH6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm14685Q52KH6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms