Protein–RNA interactions for Protein: Q501J7

Phactr4, Phosphatase and actin regulator 4, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr4Q501J7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phactr4Q501J7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Phactr4Q501J7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phactr4Q501J7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phactr4Q501J7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phactr4Q501J7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Phactr4Q501J7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phactr4Q501J7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phactr4Q501J7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phactr4Q501J7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Phactr4Q501J7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phactr4Q501J7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Phactr4Q501J7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phactr4Q501J7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phactr4Q501J7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phactr4Q501J7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phactr4Q501J7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phactr4Q501J7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phactr4Q501J7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phactr4Q501J7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phactr4Q501J7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Phactr4Q501J7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phactr4Q501J7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phactr4Q501J7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phactr4Q501J7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phactr4Q501J7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phactr4Q501J7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phactr4Q501J7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Phactr4Q501J7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phactr4Q501J7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phactr4Q501J7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phactr4Q501J7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phactr4Q501J7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phactr4Q501J7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phactr4Q501J7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phactr4Q501J7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phactr4Q501J7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phactr4Q501J7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phactr4Q501J7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phactr4Q501J7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phactr4Q501J7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phactr4Q501J7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phactr4Q501J7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phactr4Q501J7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phactr4Q501J7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phactr4Q501J7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phactr4Q501J7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phactr4Q501J7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phactr4Q501J7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phactr4Q501J7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phactr4Q501J7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Phactr4Q501J7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Phactr4Q501J7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phactr4Q501J7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phactr4Q501J7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Phactr4Q501J7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phactr4Q501J7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phactr4Q501J7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phactr4Q501J7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phactr4Q501J7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phactr4Q501J7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phactr4Q501J7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phactr4Q501J7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phactr4Q501J7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phactr4Q501J7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phactr4Q501J7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phactr4Q501J7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phactr4Q501J7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phactr4Q501J7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phactr4Q501J7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phactr4Q501J7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phactr4Q501J7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Phactr4Q501J7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Phactr4Q501J7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms