Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc27a5Q4LDG0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc27a5Q4LDG0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc27a5Q4LDG0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc27a5Q4LDG0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc27a5Q4LDG0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc27a5Q4LDG0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc27a5Q4LDG0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc27a5Q4LDG0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc27a5Q4LDG0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc27a5Q4LDG0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc27a5Q4LDG0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc27a5Q4LDG0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc27a5Q4LDG0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc27a5Q4LDG0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc27a5Q4LDG0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc27a5Q4LDG0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc27a5Q4LDG0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a5Q4LDG0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc27a5Q4LDG0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms