Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Carmil2Q3V3V9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Carmil2Q3V3V9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Carmil2Q3V3V9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Carmil2Q3V3V9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Carmil2Q3V3V9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Carmil2Q3V3V9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Carmil2Q3V3V9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Carmil2Q3V3V9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Carmil2Q3V3V9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Carmil2Q3V3V9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Carmil2Q3V3V9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Carmil2Q3V3V9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Carmil2Q3V3V9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Carmil2Q3V3V9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Carmil2Q3V3V9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Carmil2Q3V3V9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Carmil2Q3V3V9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Carmil2Q3V3V9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Carmil2Q3V3V9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Carmil2Q3V3V9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Carmil2Q3V3V9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Carmil2Q3V3V9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Carmil2Q3V3V9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Carmil2Q3V3V9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Carmil2Q3V3V9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Carmil2Q3V3V9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Carmil2Q3V3V9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Carmil2Q3V3V9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Carmil2Q3V3V9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Carmil2Q3V3V9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Carmil2Q3V3V9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Carmil2Q3V3V9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Carmil2Q3V3V9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Carmil2Q3V3V9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Carmil2Q3V3V9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Carmil2Q3V3V9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Carmil2Q3V3V9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Carmil2Q3V3V9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Carmil2Q3V3V9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Carmil2Q3V3V9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Carmil2Q3V3V9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Carmil2Q3V3V9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Carmil2Q3V3V9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Carmil2Q3V3V9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Carmil2Q3V3V9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Carmil2Q3V3V9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Carmil2Q3V3V9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Carmil2Q3V3V9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms