Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd5Q3V1H9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd5Q3V1H9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd5Q3V1H9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd5Q3V1H9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd5Q3V1H9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd5Q3V1H9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd5Q3V1H9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd5Q3V1H9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd5Q3V1H9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd5Q3V1H9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd5Q3V1H9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd5Q3V1H9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd5Q3V1H9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd5Q3V1H9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd5Q3V1H9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd5Q3V1H9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd5Q3V1H9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd5Q3V1H9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd5Q3V1H9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd5Q3V1H9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd5Q3V1H9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd5Q3V1H9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd5Q3V1H9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd5Q3V1H9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd5Q3V1H9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd5Q3V1H9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd5Q3V1H9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd5Q3V1H9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd5Q3V1H9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd5Q3V1H9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd5Q3V1H9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd5Q3V1H9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd5Q3V1H9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd5Q3V1H9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd5Q3V1H9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd5Q3V1H9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd5Q3V1H9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd5Q3V1H9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd5Q3V1H9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd5Q3V1H9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd5Q3V1H9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd5Q3V1H9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd5Q3V1H9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samd5Q3V1H9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.7 ms