Protein–RNA interactions for Protein: Q3UVD5

Lgr6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr6Q3UVD5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lgr6Q3UVD5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lgr6Q3UVD5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lgr6Q3UVD5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lgr6Q3UVD5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lgr6Q3UVD5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Lgr6Q3UVD5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lgr6Q3UVD5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lgr6Q3UVD5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lgr6Q3UVD5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lgr6Q3UVD5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lgr6Q3UVD5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lgr6Q3UVD5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lgr6Q3UVD5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lgr6Q3UVD5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lgr6Q3UVD5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lgr6Q3UVD5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lgr6Q3UVD5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lgr6Q3UVD5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lgr6Q3UVD5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Lgr6Q3UVD5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lgr6Q3UVD5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lgr6Q3UVD5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Lgr6Q3UVD5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Lgr6Q3UVD5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lgr6Q3UVD5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lgr6Q3UVD5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lgr6Q3UVD5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lgr6Q3UVD5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lgr6Q3UVD5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lgr6Q3UVD5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lgr6Q3UVD5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lgr6Q3UVD5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lgr6Q3UVD5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lgr6Q3UVD5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lgr6Q3UVD5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lgr6Q3UVD5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lgr6Q3UVD5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lgr6Q3UVD5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lgr6Q3UVD5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lgr6Q3UVD5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lgr6Q3UVD5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lgr6Q3UVD5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lgr6Q3UVD5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lgr6Q3UVD5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lgr6Q3UVD5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lgr6Q3UVD5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Lgr6Q3UVD5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lgr6Q3UVD5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lgr6Q3UVD5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lgr6Q3UVD5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Lgr6Q3UVD5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lgr6Q3UVD5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lgr6Q3UVD5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lgr6Q3UVD5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lgr6Q3UVD5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lgr6Q3UVD5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lgr6Q3UVD5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lgr6Q3UVD5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lgr6Q3UVD5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lgr6Q3UVD5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lgr6Q3UVD5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lgr6Q3UVD5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lgr6Q3UVD5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lgr6Q3UVD5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lgr6Q3UVD5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lgr6Q3UVD5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lgr6Q3UVD5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lgr6Q3UVD5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lgr6Q3UVD5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lgr6Q3UVD5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lgr6Q3UVD5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms