Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUF8

Ankrd34b, Ankyrin repeat domain-containing protein 34B, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34bQ3UUF8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd34bQ3UUF8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd34bQ3UUF8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd34bQ3UUF8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd34bQ3UUF8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd34bQ3UUF8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd34bQ3UUF8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd34bQ3UUF8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd34bQ3UUF8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd34bQ3UUF8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd34bQ3UUF8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd34bQ3UUF8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd34bQ3UUF8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd34bQ3UUF8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd34bQ3UUF8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd34bQ3UUF8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd34bQ3UUF8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ankrd34bQ3UUF8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd34bQ3UUF8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd34bQ3UUF8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd34bQ3UUF8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd34bQ3UUF8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd34bQ3UUF8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd34bQ3UUF8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd34bQ3UUF8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd34bQ3UUF8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd34bQ3UUF8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd34bQ3UUF8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd34bQ3UUF8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd34bQ3UUF8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd34bQ3UUF8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd34bQ3UUF8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd34bQ3UUF8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ankrd34bQ3UUF8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ankrd34bQ3UUF8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ankrd34bQ3UUF8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd34bQ3UUF8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd34bQ3UUF8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd34bQ3UUF8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd34bQ3UUF8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd34bQ3UUF8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd34bQ3UUF8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ankrd34bQ3UUF8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ankrd34bQ3UUF8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ankrd34bQ3UUF8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ankrd34bQ3UUF8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd34bQ3UUF8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd34bQ3UUF8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd34bQ3UUF8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd34bQ3UUF8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd34bQ3UUF8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd34bQ3UUF8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd34bQ3UUF8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd34bQ3UUF8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd34bQ3UUF8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd34bQ3UUF8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd34bQ3UUF8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd34bQ3UUF8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd34bQ3UUF8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd34bQ3UUF8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd34bQ3UUF8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd34bQ3UUF8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd34bQ3UUF8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd34bQ3UUF8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd34bQ3UUF8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ankrd34bQ3UUF8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd34bQ3UUF8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd34bQ3UUF8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd34bQ3UUF8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd34bQ3UUF8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms