Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx27Q3UHD6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx27Q3UHD6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx27Q3UHD6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx27Q3UHD6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx27Q3UHD6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx27Q3UHD6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx27Q3UHD6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx27Q3UHD6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx27Q3UHD6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx27Q3UHD6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx27Q3UHD6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx27Q3UHD6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx27Q3UHD6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Snx27Q3UHD6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx27Q3UHD6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx27Q3UHD6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx27Q3UHD6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx27Q3UHD6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx27Q3UHD6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx27Q3UHD6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx27Q3UHD6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx27Q3UHD6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx27Q3UHD6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx27Q3UHD6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx27Q3UHD6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx27Q3UHD6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx27Q3UHD6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx27Q3UHD6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx27Q3UHD6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx27Q3UHD6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx27Q3UHD6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx27Q3UHD6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx27Q3UHD6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx27Q3UHD6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx27Q3UHD6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx27Q3UHD6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx27Q3UHD6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx27Q3UHD6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx27Q3UHD6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx27Q3UHD6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx27Q3UHD6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx27Q3UHD6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx27Q3UHD6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx27Q3UHD6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx27Q3UHD6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx27Q3UHD6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx27Q3UHD6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx27Q3UHD6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx27Q3UHD6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx27Q3UHD6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx27Q3UHD6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx27Q3UHD6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx27Q3UHD6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx27Q3UHD6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx27Q3UHD6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx27Q3UHD6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx27Q3UHD6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx27Q3UHD6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx27Q3UHD6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx27Q3UHD6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx27Q3UHD6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx27Q3UHD6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx27Q3UHD6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx27Q3UHD6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx27Q3UHD6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx27Q3UHD6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx27Q3UHD6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx27Q3UHD6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx27Q3UHD6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx27Q3UHD6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx27Q3UHD6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx27Q3UHD6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx27Q3UHD6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx27Q3UHD6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx27Q3UHD6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx27Q3UHD6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx27Q3UHD6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx27Q3UHD6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx27Q3UHD6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx27Q3UHD6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx27Q3UHD6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Snx27Q3UHD6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx27Q3UHD6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx27Q3UHD6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx27Q3UHD6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx27Q3UHD6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx27Q3UHD6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx27Q3UHD6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx27Q3UHD6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx27Q3UHD6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx27Q3UHD6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx27Q3UHD6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx27Q3UHD6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx27Q3UHD6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx27Q3UHD6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx27Q3UHD6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx27Q3UHD6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx27Q3UHD6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx27Q3UHD6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms