Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc58Q3UGP9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc58Q3UGP9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc58Q3UGP9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms