Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGC7

Eif3j1, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3j1Q3UGC7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3j1Q3UGC7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3j1Q3UGC7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3j1Q3UGC7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3j1Q3UGC7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3j1Q3UGC7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3j1Q3UGC7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif3j1Q3UGC7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif3j1Q3UGC7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif3j1Q3UGC7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif3j1Q3UGC7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif3j1Q3UGC7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif3j1Q3UGC7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif3j1Q3UGC7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif3j1Q3UGC7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif3j1Q3UGC7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eif3j1Q3UGC7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Eif3j1Q3UGC7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Eif3j1Q3UGC7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif3j1Q3UGC7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif3j1Q3UGC7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif3j1Q3UGC7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eif3j1Q3UGC7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eif3j1Q3UGC7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eif3j1Q3UGC7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eif3j1Q3UGC7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eif3j1Q3UGC7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eif3j1Q3UGC7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eif3j1Q3UGC7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eif3j1Q3UGC7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Eif3j1Q3UGC7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Eif3j1Q3UGC7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Eif3j1Q3UGC7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Eif3j1Q3UGC7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Eif3j1Q3UGC7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Eif3j1Q3UGC7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Eif3j1Q3UGC7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Eif3j1Q3UGC7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Eif3j1Q3UGC7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Eif3j1Q3UGC7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Eif3j1Q3UGC7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Eif3j1Q3UGC7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Eif3j1Q3UGC7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Eif3j1Q3UGC7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Eif3j1Q3UGC7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Eif3j1Q3UGC7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Eif3j1Q3UGC7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Eif3j1Q3UGC7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Eif3j1Q3UGC7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Eif3j1Q3UGC7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Eif3j1Q3UGC7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Eif3j1Q3UGC7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Eif3j1Q3UGC7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Eif3j1Q3UGC7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Eif3j1Q3UGC7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Eif3j1Q3UGC7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Eif3j1Q3UGC7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Eif3j1Q3UGC7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Eif3j1Q3UGC7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Eif3j1Q3UGC7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Eif3j1Q3UGC7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Eif3j1Q3UGC7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Eif3j1Q3UGC7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Eif3j1Q3UGC7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Eif3j1Q3UGC7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Eif3j1Q3UGC7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Eif3j1Q3UGC7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Eif3j1Q3UGC7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Eif3j1Q3UGC7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Eif3j1Q3UGC7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms