Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U3

Fbxo7, F-box only protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo7Q3U7U3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo7Q3U7U3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo7Q3U7U3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo7Q3U7U3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo7Q3U7U3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo7Q3U7U3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo7Q3U7U3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo7Q3U7U3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo7Q3U7U3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fbxo7Q3U7U3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Fbxo7Q3U7U3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo7Q3U7U3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo7Q3U7U3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo7Q3U7U3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo7Q3U7U3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo7Q3U7U3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo7Q3U7U3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo7Q3U7U3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo7Q3U7U3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo7Q3U7U3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo7Q3U7U3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo7Q3U7U3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo7Q3U7U3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo7Q3U7U3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo7Q3U7U3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo7Q3U7U3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo7Q3U7U3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo7Q3U7U3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo7Q3U7U3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo7Q3U7U3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo7Q3U7U3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo7Q3U7U3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo7Q3U7U3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo7Q3U7U3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo7Q3U7U3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Fbxo7Q3U7U3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fbxo7Q3U7U3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fbxo7Q3U7U3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo7Q3U7U3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo7Q3U7U3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo7Q3U7U3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo7Q3U7U3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo7Q3U7U3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo7Q3U7U3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo7Q3U7U3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo7Q3U7U3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo7Q3U7U3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo7Q3U7U3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo7Q3U7U3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo7Q3U7U3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo7Q3U7U3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo7Q3U7U3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo7Q3U7U3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo7Q3U7U3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo7Q3U7U3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo7Q3U7U3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo7Q3U7U3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo7Q3U7U3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo7Q3U7U3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms