Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ulk3Q3U3Q1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ulk3Q3U3Q1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ulk3Q3U3Q1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ulk3Q3U3Q1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ulk3Q3U3Q1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ulk3Q3U3Q1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ulk3Q3U3Q1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ulk3Q3U3Q1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ulk3Q3U3Q1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ulk3Q3U3Q1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ulk3Q3U3Q1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms