Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hvcn1Q3U2S8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hvcn1Q3U2S8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hvcn1Q3U2S8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hvcn1Q3U2S8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hvcn1Q3U2S8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hvcn1Q3U2S8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hvcn1Q3U2S8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hvcn1Q3U2S8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hvcn1Q3U2S8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hvcn1Q3U2S8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hvcn1Q3U2S8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hvcn1Q3U2S8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hvcn1Q3U2S8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hvcn1Q3U2S8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hvcn1Q3U2S8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hvcn1Q3U2S8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hvcn1Q3U2S8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hvcn1Q3U2S8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hvcn1Q3U2S8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hvcn1Q3U2S8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hvcn1Q3U2S8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hvcn1Q3U2S8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hvcn1Q3U2S8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hvcn1Q3U2S8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hvcn1Q3U2S8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hvcn1Q3U2S8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hvcn1Q3U2S8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hvcn1Q3U2S8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hvcn1Q3U2S8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hvcn1Q3U2S8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hvcn1Q3U2S8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hvcn1Q3U2S8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hvcn1Q3U2S8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hvcn1Q3U2S8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hvcn1Q3U2S8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hvcn1Q3U2S8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hvcn1Q3U2S8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hvcn1Q3U2S8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hvcn1Q3U2S8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hvcn1Q3U2S8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hvcn1Q3U2S8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hvcn1Q3U2S8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hvcn1Q3U2S8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hvcn1Q3U2S8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hvcn1Q3U2S8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hvcn1Q3U2S8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hvcn1Q3U2S8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hvcn1Q3U2S8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hvcn1Q3U2S8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hvcn1Q3U2S8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hvcn1Q3U2S8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Hvcn1Q3U2S8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hvcn1Q3U2S8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hvcn1Q3U2S8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hvcn1Q3U2S8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hvcn1Q3U2S8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hvcn1Q3U2S8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Hvcn1Q3U2S8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Hvcn1Q3U2S8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hvcn1Q3U2S8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hvcn1Q3U2S8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hvcn1Q3U2S8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hvcn1Q3U2S8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hvcn1Q3U2S8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hvcn1Q3U2S8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hvcn1Q3U2S8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hvcn1Q3U2S8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hvcn1Q3U2S8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hvcn1Q3U2S8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hvcn1Q3U2S8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hvcn1Q3U2S8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hvcn1Q3U2S8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hvcn1Q3U2S8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hvcn1Q3U2S8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hvcn1Q3U2S8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hvcn1Q3U2S8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hvcn1Q3U2S8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hvcn1Q3U2S8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hvcn1Q3U2S8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hvcn1Q3U2S8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Hvcn1Q3U2S8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hvcn1Q3U2S8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hvcn1Q3U2S8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hvcn1Q3U2S8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hvcn1Q3U2S8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Hvcn1Q3U2S8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hvcn1Q3U2S8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hvcn1Q3U2S8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hvcn1Q3U2S8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hvcn1Q3U2S8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hvcn1Q3U2S8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hvcn1Q3U2S8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hvcn1Q3U2S8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hvcn1Q3U2S8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hvcn1Q3U2S8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hvcn1Q3U2S8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hvcn1Q3U2S8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Hvcn1Q3U2S8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms