Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26,17■■□□□ 1,78
Otud5Q3U2S4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26,17■■□□□ 1,78
Otud5Q3U2S4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Otud5Q3U2S4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26,16■■□□□ 1,78
Otud5Q3U2S4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Otud5Q3U2S4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Otud5Q3U2S4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Otud5Q3U2S4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Otud5Q3U2S4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26,15■■□□□ 1,78
Otud5Q3U2S4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Otud5Q3U2S4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Otud5Q3U2S4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26,14■■□□□ 1,78
Otud5Q3U2S4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Otud5Q3U2S4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Otud5Q3U2S4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Otud5Q3U2S4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Otud5Q3U2S4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Otud5Q3U2S4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Otud5Q3U2S4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Otud5Q3U2S4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Otud5Q3U2S4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Otud5Q3U2S4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Otud5Q3U2S4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Otud5Q3U2S4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Otud5Q3U2S4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Otud5Q3U2S4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Otud5Q3U2S4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26,11■■□□□ 1,77
Otud5Q3U2S4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Otud5Q3U2S4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Otud5Q3U2S4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Otud5Q3U2S4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Otud5Q3U2S4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Otud5Q3U2S4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Otud5Q3U2S4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Otud5Q3U2S4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Otud5Q3U2S4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Otud5Q3U2S4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26,08■■□□□ 1,77
Otud5Q3U2S4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Otud5Q3U2S4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,76
Otud5Q3U2S4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26,07■■□□□ 1,76
Otud5Q3U2S4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Otud5Q3U2S4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Otud5Q3U2S4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Otud5Q3U2S4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Otud5Q3U2S4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Otud5Q3U2S4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Otud5Q3U2S4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Otud5Q3U2S4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Otud5Q3U2S4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26,06■■□□□ 1,76
Otud5Q3U2S4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Otud5Q3U2S4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Otud5Q3U2S4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26,05■■□□□ 1,76
Otud5Q3U2S4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Otud5Q3U2S4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,05■■□□□ 1,76
Otud5Q3U2S4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Otud5Q3U2S4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Otud5Q3U2S4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Otud5Q3U2S4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Otud5Q3U2S4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Otud5Q3U2S4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26,02■■□□□ 1,76
Otud5Q3U2S4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Otud5Q3U2S4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Otud5Q3U2S4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Otud5Q3U2S4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26,01■■□□□ 1,75
Otud5Q3U2S4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1,75
Otud5Q3U2S4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Otud5Q3U2S4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1,75
Otud5Q3U2S4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25,99■■□□□ 1,75
Otud5Q3U2S4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Otud5Q3U2S4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Otud5Q3U2S4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Otud5Q3U2S4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Otud5Q3U2S4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Otud5Q3U2S4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Otud5Q3U2S4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Otud5Q3U2S4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Otud5Q3U2S4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Otud5Q3U2S4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Otud5Q3U2S4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Otud5Q3U2S4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Otud5Q3U2S4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Otud5Q3U2S4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25,96■■□□□ 1,75
Otud5Q3U2S4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,96■■□□□ 1,75
Otud5Q3U2S4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Otud5Q3U2S4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25,95■■□□□ 1,74
Otud5Q3U2S4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Otud5Q3U2S4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Otud5Q3U2S4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Otud5Q3U2S4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Otud5Q3U2S4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Otud5Q3U2S4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Otud5Q3U2S4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Otud5Q3U2S4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Otud5Q3U2S4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Otud5Q3U2S4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Otud5Q3U2S4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Otud5Q3U2S4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Otud5Q3U2S4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Otud5Q3U2S4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Otud5Q3U2S4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,1 ms