Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0S6

Rasip1, Ras-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasip1Q3U0S6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rasip1Q3U0S6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rasip1Q3U0S6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rasip1Q3U0S6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rasip1Q3U0S6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rasip1Q3U0S6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rasip1Q3U0S6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rasip1Q3U0S6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rasip1Q3U0S6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rasip1Q3U0S6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rasip1Q3U0S6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rasip1Q3U0S6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rasip1Q3U0S6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rasip1Q3U0S6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rasip1Q3U0S6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rasip1Q3U0S6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rasip1Q3U0S6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rasip1Q3U0S6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rasip1Q3U0S6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rasip1Q3U0S6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rasip1Q3U0S6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rasip1Q3U0S6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rasip1Q3U0S6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rasip1Q3U0S6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rasip1Q3U0S6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rasip1Q3U0S6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rasip1Q3U0S6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rasip1Q3U0S6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rasip1Q3U0S6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rasip1Q3U0S6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rasip1Q3U0S6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rasip1Q3U0S6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rasip1Q3U0S6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rasip1Q3U0S6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rasip1Q3U0S6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rasip1Q3U0S6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rasip1Q3U0S6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rasip1Q3U0S6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rasip1Q3U0S6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rasip1Q3U0S6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rasip1Q3U0S6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rasip1Q3U0S6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rasip1Q3U0S6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rasip1Q3U0S6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rasip1Q3U0S6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rasip1Q3U0S6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rasip1Q3U0S6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rasip1Q3U0S6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rasip1Q3U0S6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rasip1Q3U0S6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rasip1Q3U0S6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rasip1Q3U0S6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rasip1Q3U0S6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rasip1Q3U0S6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rasip1Q3U0S6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rasip1Q3U0S6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rasip1Q3U0S6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rasip1Q3U0S6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rasip1Q3U0S6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rasip1Q3U0S6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rasip1Q3U0S6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rasip1Q3U0S6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rasip1Q3U0S6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rasip1Q3U0S6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rasip1Q3U0S6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rasip1Q3U0S6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rasip1Q3U0S6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rasip1Q3U0S6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rasip1Q3U0S6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rasip1Q3U0S6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rasip1Q3U0S6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rasip1Q3U0S6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rasip1Q3U0S6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rasip1Q3U0S6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rasip1Q3U0S6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rasip1Q3U0S6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rasip1Q3U0S6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rasip1Q3U0S6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rasip1Q3U0S6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rasip1Q3U0S6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rasip1Q3U0S6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rasip1Q3U0S6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rasip1Q3U0S6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rasip1Q3U0S6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Rasip1Q3U0S6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rasip1Q3U0S6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rasip1Q3U0S6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rasip1Q3U0S6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rasip1Q3U0S6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rasip1Q3U0S6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rasip1Q3U0S6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rasip1Q3U0S6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rasip1Q3U0S6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rasip1Q3U0S6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rasip1Q3U0S6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rasip1Q3U0S6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rasip1Q3U0S6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rasip1Q3U0S6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rasip1Q3U0S6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rasip1Q3U0S6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.6 ms