Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc9Q3U0M1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc9Q3U0M1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc9Q3U0M1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc9Q3U0M1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc9Q3U0M1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc9Q3U0M1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc9Q3U0M1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc9Q3U0M1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc9Q3U0M1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc9Q3U0M1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc9Q3U0M1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc9Q3U0M1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc9Q3U0M1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc9Q3U0M1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc9Q3U0M1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc9Q3U0M1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc9Q3U0M1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc9Q3U0M1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc9Q3U0M1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc9Q3U0M1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc9Q3U0M1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc9Q3U0M1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc9Q3U0M1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc9Q3U0M1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc9Q3U0M1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc9Q3U0M1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc9Q3U0M1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc9Q3U0M1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc9Q3U0M1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc9Q3U0M1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc9Q3U0M1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc9Q3U0M1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc9Q3U0M1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc9Q3U0M1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc9Q3U0M1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc9Q3U0M1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc9Q3U0M1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc9Q3U0M1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc9Q3U0M1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc9Q3U0M1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trappc9Q3U0M1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc9Q3U0M1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc9Q3U0M1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc9Q3U0M1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc9Q3U0M1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc9Q3U0M1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc9Q3U0M1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc9Q3U0M1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc9Q3U0M1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc9Q3U0M1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc9Q3U0M1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc9Q3U0M1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc9Q3U0M1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc9Q3U0M1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc9Q3U0M1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc9Q3U0M1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc9Q3U0M1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc9Q3U0M1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc9Q3U0M1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc9Q3U0M1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc9Q3U0M1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc9Q3U0M1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc9Q3U0M1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc9Q3U0M1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc9Q3U0M1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc9Q3U0M1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc9Q3U0M1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms