Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX3

Zfyve27, Protrudin, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfyve27Q3TXX3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfyve27Q3TXX3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfyve27Q3TXX3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfyve27Q3TXX3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfyve27Q3TXX3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfyve27Q3TXX3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfyve27Q3TXX3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfyve27Q3TXX3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfyve27Q3TXX3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfyve27Q3TXX3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfyve27Q3TXX3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfyve27Q3TXX3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfyve27Q3TXX3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfyve27Q3TXX3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfyve27Q3TXX3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfyve27Q3TXX3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfyve27Q3TXX3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfyve27Q3TXX3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zfyve27Q3TXX3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfyve27Q3TXX3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfyve27Q3TXX3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfyve27Q3TXX3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfyve27Q3TXX3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfyve27Q3TXX3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfyve27Q3TXX3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfyve27Q3TXX3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfyve27Q3TXX3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfyve27Q3TXX3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfyve27Q3TXX3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfyve27Q3TXX3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfyve27Q3TXX3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfyve27Q3TXX3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfyve27Q3TXX3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfyve27Q3TXX3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfyve27Q3TXX3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfyve27Q3TXX3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfyve27Q3TXX3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfyve27Q3TXX3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfyve27Q3TXX3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfyve27Q3TXX3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfyve27Q3TXX3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfyve27Q3TXX3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfyve27Q3TXX3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfyve27Q3TXX3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms