Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdpd4Q3TT99 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdpd4Q3TT99 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdpd4Q3TT99 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdpd4Q3TT99 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdpd4Q3TT99 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdpd4Q3TT99 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gdpd4Q3TT99 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gdpd4Q3TT99 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gdpd4Q3TT99 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gdpd4Q3TT99 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gdpd4Q3TT99 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gdpd4Q3TT99 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gdpd4Q3TT99 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gdpd4Q3TT99 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gdpd4Q3TT99 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gdpd4Q3TT99 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gdpd4Q3TT99 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gdpd4Q3TT99 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gdpd4Q3TT99 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gdpd4Q3TT99 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gdpd4Q3TT99 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gdpd4Q3TT99 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gdpd4Q3TT99 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gdpd4Q3TT99 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gdpd4Q3TT99 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gdpd4Q3TT99 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gdpd4Q3TT99 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gdpd4Q3TT99 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gdpd4Q3TT99 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gdpd4Q3TT99 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gdpd4Q3TT99 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gdpd4Q3TT99 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gdpd4Q3TT99 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gdpd4Q3TT99 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gdpd4Q3TT99 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gdpd4Q3TT99 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gdpd4Q3TT99 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gdpd4Q3TT99 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gdpd4Q3TT99 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gdpd4Q3TT99 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gdpd4Q3TT99 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gdpd4Q3TT99 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gdpd4Q3TT99 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdpd4Q3TT99 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdpd4Q3TT99 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdpd4Q3TT99 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdpd4Q3TT99 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdpd4Q3TT99 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdpd4Q3TT99 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdpd4Q3TT99 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdpd4Q3TT99 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdpd4Q3TT99 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdpd4Q3TT99 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdpd4Q3TT99 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdpd4Q3TT99 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdpd4Q3TT99 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdpd4Q3TT99 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdpd4Q3TT99 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdpd4Q3TT99 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdpd4Q3TT99 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdpd4Q3TT99 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdpd4Q3TT99 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdpd4Q3TT99 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdpd4Q3TT99 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms