Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CiartQ3TQ03 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CiartQ3TQ03 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CiartQ3TQ03 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CiartQ3TQ03 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CiartQ3TQ03 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CiartQ3TQ03 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CiartQ3TQ03 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CiartQ3TQ03 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CiartQ3TQ03 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CiartQ3TQ03 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CiartQ3TQ03 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CiartQ3TQ03 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CiartQ3TQ03 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CiartQ3TQ03 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CiartQ3TQ03 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CiartQ3TQ03 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CiartQ3TQ03 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CiartQ3TQ03 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CiartQ3TQ03 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CiartQ3TQ03 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CiartQ3TQ03 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CiartQ3TQ03 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CiartQ3TQ03 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CiartQ3TQ03 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CiartQ3TQ03 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CiartQ3TQ03 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CiartQ3TQ03 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CiartQ3TQ03 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CiartQ3TQ03 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms