Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC93

Hs1bp3, HCLS1-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs1bp3Q3TC93 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Hs1bp3Q3TC93 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hs1bp3Q3TC93 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Hs1bp3Q3TC93 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hs1bp3Q3TC93 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hs1bp3Q3TC93 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hs1bp3Q3TC93 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Hs1bp3Q3TC93 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hs1bp3Q3TC93 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hs1bp3Q3TC93 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Hs1bp3Q3TC93 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hs1bp3Q3TC93 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hs1bp3Q3TC93 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hs1bp3Q3TC93 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hs1bp3Q3TC93 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hs1bp3Q3TC93 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hs1bp3Q3TC93 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hs1bp3Q3TC93 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hs1bp3Q3TC93 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hs1bp3Q3TC93 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hs1bp3Q3TC93 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hs1bp3Q3TC93 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Hs1bp3Q3TC93 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hs1bp3Q3TC93 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Hs1bp3Q3TC93 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Hs1bp3Q3TC93 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Hs1bp3Q3TC93 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hs1bp3Q3TC93 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hs1bp3Q3TC93 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hs1bp3Q3TC93 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hs1bp3Q3TC93 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hs1bp3Q3TC93 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hs1bp3Q3TC93 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hs1bp3Q3TC93 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hs1bp3Q3TC93 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hs1bp3Q3TC93 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hs1bp3Q3TC93 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hs1bp3Q3TC93 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hs1bp3Q3TC93 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hs1bp3Q3TC93 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hs1bp3Q3TC93 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Hs1bp3Q3TC93 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hs1bp3Q3TC93 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hs1bp3Q3TC93 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hs1bp3Q3TC93 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hs1bp3Q3TC93 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Hs1bp3Q3TC93 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hs1bp3Q3TC93 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hs1bp3Q3TC93 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hs1bp3Q3TC93 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hs1bp3Q3TC93 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hs1bp3Q3TC93 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hs1bp3Q3TC93 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms