Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
V1rd19Q3KNP5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
V1rd19Q3KNP5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
V1rd19Q3KNP5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms