Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12,76□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12,76□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC12,76□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC12,76□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,76□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12,75□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC12,75□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC12,75□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12,75□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12,75□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC12,75□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12,75□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,75□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC12,75□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,75□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,75□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC12,75□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,75□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12,74□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC12,74□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,74□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,74□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC12,74□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC12,74□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,74□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12,74□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,73□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,73□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12,72□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC12,72□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC12,72□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12,72□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,71□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC12,71□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,71□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC12,71□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC12,71□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC12,71□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC12,71□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,71□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC12,7□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC12,7□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12,7□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12,7□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12,7□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC12,7□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12,7□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12,7□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC12,69□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC12,69□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,69□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12,69□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,69□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,69□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,69□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,69□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12,68□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC12,68□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,68□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC12,68□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12,68□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12,68□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,67□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12,67□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC12,67□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,67□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC12,67□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,67□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC12,67□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC12,67□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC12,67□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12,66□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC12,66□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,66□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC12,66□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12,66□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12,66□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12,66□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,66□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,66□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC12,65□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC12,65□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC12,65□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC12,65□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC12,65□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,65□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,65□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC12,65□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,65□□□□□ -0,38
Ush2AQ2QI47 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12,64□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC12,64□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,64□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,64□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC12,64□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,63□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC12,63□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC12,63□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,63□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,63□□□□□ -0,39
Ush2AQ2QI47 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12,63□□□□□ -0,39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,7 ms