Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim71Q1PSW8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim71Q1PSW8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim71Q1PSW8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim71Q1PSW8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim71Q1PSW8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim71Q1PSW8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim71Q1PSW8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim71Q1PSW8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim71Q1PSW8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim71Q1PSW8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim71Q1PSW8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim71Q1PSW8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim71Q1PSW8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim71Q1PSW8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim71Q1PSW8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim71Q1PSW8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim71Q1PSW8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim71Q1PSW8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim71Q1PSW8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim71Q1PSW8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim71Q1PSW8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim71Q1PSW8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim71Q1PSW8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim71Q1PSW8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim71Q1PSW8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim71Q1PSW8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim71Q1PSW8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim71Q1PSW8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim71Q1PSW8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim71Q1PSW8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim71Q1PSW8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim71Q1PSW8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim71Q1PSW8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim71Q1PSW8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim71Q1PSW8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim71Q1PSW8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim71Q1PSW8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim71Q1PSW8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim71Q1PSW8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim71Q1PSW8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim71Q1PSW8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim71Q1PSW8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim71Q1PSW8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim71Q1PSW8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim71Q1PSW8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
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