Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBK2

Krt80, Keratin, type II cytoskeletal 80, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt80Q0VBK2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt80Q0VBK2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt80Q0VBK2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt80Q0VBK2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt80Q0VBK2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt80Q0VBK2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt80Q0VBK2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt80Q0VBK2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt80Q0VBK2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt80Q0VBK2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt80Q0VBK2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt80Q0VBK2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt80Q0VBK2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt80Q0VBK2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt80Q0VBK2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt80Q0VBK2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt80Q0VBK2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt80Q0VBK2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt80Q0VBK2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt80Q0VBK2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt80Q0VBK2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt80Q0VBK2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt80Q0VBK2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt80Q0VBK2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt80Q0VBK2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt80Q0VBK2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt80Q0VBK2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt80Q0VBK2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt80Q0VBK2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt80Q0VBK2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt80Q0VBK2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt80Q0VBK2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt80Q0VBK2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt80Q0VBK2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt80Q0VBK2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt80Q0VBK2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt80Q0VBK2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt80Q0VBK2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt80Q0VBK2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt80Q0VBK2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt80Q0VBK2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt80Q0VBK2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt80Q0VBK2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt80Q0VBK2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt80Q0VBK2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt80Q0VBK2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt80Q0VBK2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt80Q0VBK2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt80Q0VBK2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt80Q0VBK2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt80Q0VBK2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt80Q0VBK2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt80Q0VBK2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt80Q0VBK2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt80Q0VBK2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt80Q0VBK2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt80Q0VBK2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt80Q0VBK2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt80Q0VBK2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krt80Q0VBK2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt80Q0VBK2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt80Q0VBK2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt80Q0VBK2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt80Q0VBK2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt80Q0VBK2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt80Q0VBK2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt80Q0VBK2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt80Q0VBK2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt80Q0VBK2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt80Q0VBK2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt80Q0VBK2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt80Q0VBK2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt80Q0VBK2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt80Q0VBK2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt80Q0VBK2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt80Q0VBK2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt80Q0VBK2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt80Q0VBK2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt80Q0VBK2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt80Q0VBK2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt80Q0VBK2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt80Q0VBK2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt80Q0VBK2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt80Q0VBK2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt80Q0VBK2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt80Q0VBK2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt80Q0VBK2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt80Q0VBK2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt80Q0VBK2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt80Q0VBK2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt80Q0VBK2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt80Q0VBK2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt80Q0VBK2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt80Q0VBK2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt80Q0VBK2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt80Q0VBK2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt80Q0VBK2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt80Q0VBK2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt80Q0VBK2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt80Q0VBK2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms