Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cntnap5bQ0V8T8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cntnap5bQ0V8T8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cntnap5bQ0V8T8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cntnap5bQ0V8T8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cntnap5bQ0V8T8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cntnap5bQ0V8T8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cntnap5bQ0V8T8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cntnap5bQ0V8T8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cntnap5bQ0V8T8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cntnap5bQ0V8T8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cntnap5bQ0V8T8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cntnap5bQ0V8T8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cntnap5bQ0V8T8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cntnap5bQ0V8T8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cntnap5bQ0V8T8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cntnap5bQ0V8T8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cntnap5bQ0V8T8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cntnap5bQ0V8T8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cntnap5bQ0V8T8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cntnap5bQ0V8T8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cntnap5bQ0V8T8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cntnap5bQ0V8T8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cntnap5bQ0V8T8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cntnap5bQ0V8T8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cntnap5bQ0V8T8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cntnap5bQ0V8T8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cntnap5bQ0V8T8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cntnap5bQ0V8T8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cntnap5bQ0V8T8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cntnap5bQ0V8T8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cntnap5bQ0V8T8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cntnap5bQ0V8T8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cntnap5bQ0V8T8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cntnap5bQ0V8T8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cntnap5bQ0V8T8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cntnap5bQ0V8T8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cntnap5bQ0V8T8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cntnap5bQ0V8T8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cntnap5bQ0V8T8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cntnap5bQ0V8T8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cntnap5bQ0V8T8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cntnap5bQ0V8T8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cntnap5bQ0V8T8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cntnap5bQ0V8T8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cntnap5bQ0V8T8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cntnap5bQ0V8T8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cntnap5bQ0V8T8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cntnap5bQ0V8T8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cntnap5bQ0V8T8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cntnap5bQ0V8T8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cntnap5bQ0V8T8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cntnap5bQ0V8T8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cntnap5bQ0V8T8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cntnap5bQ0V8T8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cntnap5bQ0V8T8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cntnap5bQ0V8T8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cntnap5bQ0V8T8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cntnap5bQ0V8T8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cntnap5bQ0V8T8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cntnap5bQ0V8T8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cntnap5bQ0V8T8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cntnap5bQ0V8T8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cntnap5bQ0V8T8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cntnap5bQ0V8T8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cntnap5bQ0V8T8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cntnap5bQ0V8T8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cntnap5bQ0V8T8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cntnap5bQ0V8T8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cntnap5bQ0V8T8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cntnap5bQ0V8T8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cntnap5bQ0V8T8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cntnap5bQ0V8T8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cntnap5bQ0V8T8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cntnap5bQ0V8T8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cntnap5bQ0V8T8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cntnap5bQ0V8T8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cntnap5bQ0V8T8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cntnap5bQ0V8T8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cntnap5bQ0V8T8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cntnap5bQ0V8T8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cntnap5bQ0V8T8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cntnap5bQ0V8T8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cntnap5bQ0V8T8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cntnap5bQ0V8T8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cntnap5bQ0V8T8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cntnap5bQ0V8T8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cntnap5bQ0V8T8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms