Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnn1Q08091 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnn1Q08091 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnn1Q08091 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnn1Q08091 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnn1Q08091 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnn1Q08091 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnn1Q08091 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnn1Q08091 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnn1Q08091 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnn1Q08091 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms