Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gdf3Q07104 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gdf3Q07104 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gdf3Q07104 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gdf3Q07104 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gdf3Q07104 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gdf3Q07104 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gdf3Q07104 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gdf3Q07104 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gdf3Q07104 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gdf3Q07104 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gdf3Q07104 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gdf3Q07104 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gdf3Q07104 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gdf3Q07104 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gdf3Q07104 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gdf3Q07104 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gdf3Q07104 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gdf3Q07104 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gdf3Q07104 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gdf3Q07104 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gdf3Q07104 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gdf3Q07104 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gdf3Q07104 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gdf3Q07104 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gdf3Q07104 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gdf3Q07104 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gdf3Q07104 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gdf3Q07104 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gdf3Q07104 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gdf3Q07104 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gdf3Q07104 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gdf3Q07104 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gdf3Q07104 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gdf3Q07104 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gdf3Q07104 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gdf3Q07104 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gdf3Q07104 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gdf3Q07104 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gdf3Q07104 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gdf3Q07104 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gdf3Q07104 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gdf3Q07104 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gdf3Q07104 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gdf3Q07104 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gdf3Q07104 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms