Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hspg2Q05793 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hspg2Q05793 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hspg2Q05793 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hspg2Q05793 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hspg2Q05793 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hspg2Q05793 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hspg2Q05793 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hspg2Q05793 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hspg2Q05793 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hspg2Q05793 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hspg2Q05793 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hspg2Q05793 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hspg2Q05793 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hspg2Q05793 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hspg2Q05793 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hspg2Q05793 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hspg2Q05793 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hspg2Q05793 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hspg2Q05793 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hspg2Q05793 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hspg2Q05793 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hspg2Q05793 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hspg2Q05793 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hspg2Q05793 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hspg2Q05793 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hspg2Q05793 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hspg2Q05793 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hspg2Q05793 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hspg2Q05793 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hspg2Q05793 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hspg2Q05793 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hspg2Q05793 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hspg2Q05793 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hspg2Q05793 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hspg2Q05793 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hspg2Q05793 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hspg2Q05793 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hspg2Q05793 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hspg2Q05793 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hspg2Q05793 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hspg2Q05793 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hspg2Q05793 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms