Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col9a1Q05722 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col9a1Q05722 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col9a1Q05722 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col9a1Q05722 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col9a1Q05722 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col9a1Q05722 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col9a1Q05722 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col9a1Q05722 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col9a1Q05722 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col9a1Q05722 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col9a1Q05722 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col9a1Q05722 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col9a1Q05722 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col9a1Q05722 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col9a1Q05722 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col9a1Q05722 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col9a1Q05722 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col9a1Q05722 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col9a1Q05722 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col9a1Q05722 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col9a1Q05722 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col9a1Q05722 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col9a1Q05722 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col9a1Q05722 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col9a1Q05722 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col9a1Q05722 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col9a1Q05722 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col9a1Q05722 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col9a1Q05722 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col9a1Q05722 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col9a1Q05722 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col9a1Q05722 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Col9a1Q05722 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col9a1Q05722 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col9a1Q05722 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col9a1Q05722 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col9a1Q05722 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col9a1Q05722 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Col9a1Q05722 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col9a1Q05722 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col9a1Q05722 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Col9a1Q05722 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col9a1Q05722 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col9a1Q05722 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col9a1Q05722 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms