Protein–RNA interactions for Protein: Q03147

Cdk7, Cyclin-dependent kinase 7, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk7Q03147 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk7Q03147 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk7Q03147 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk7Q03147 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk7Q03147 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk7Q03147 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk7Q03147 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk7Q03147 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk7Q03147 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk7Q03147 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk7Q03147 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk7Q03147 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk7Q03147 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk7Q03147 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk7Q03147 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk7Q03147 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk7Q03147 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk7Q03147 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk7Q03147 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk7Q03147 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk7Q03147 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk7Q03147 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk7Q03147 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk7Q03147 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk7Q03147 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk7Q03147 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk7Q03147 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk7Q03147 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk7Q03147 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk7Q03147 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk7Q03147 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk7Q03147 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms