Protein–RNA interactions for Protein: Q03141

Mark3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark3Q03141 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mark3Q03141 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mark3Q03141 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mark3Q03141 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mark3Q03141 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mark3Q03141 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mark3Q03141 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mark3Q03141 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mark3Q03141 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mark3Q03141 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mark3Q03141 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mark3Q03141 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mark3Q03141 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mark3Q03141 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mark3Q03141 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Mark3Q03141 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mark3Q03141 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mark3Q03141 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mark3Q03141 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mark3Q03141 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mark3Q03141 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mark3Q03141 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mark3Q03141 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mark3Q03141 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mark3Q03141 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mark3Q03141 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mark3Q03141 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Mark3Q03141 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mark3Q03141 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mark3Q03141 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mark3Q03141 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mark3Q03141 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mark3Q03141 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mark3Q03141 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mark3Q03141 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mark3Q03141 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Mark3Q03141 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mark3Q03141 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mark3Q03141 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Mark3Q03141 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mark3Q03141 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mark3Q03141 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mark3Q03141 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mark3Q03141 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mark3Q03141 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mark3Q03141 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mark3Q03141 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mark3Q03141 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mark3Q03141 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mark3Q03141 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mark3Q03141 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Mark3Q03141 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mark3Q03141 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mark3Q03141 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mark3Q03141 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mark3Q03141 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mark3Q03141 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mark3Q03141 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mark3Q03141 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mark3Q03141 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mark3Q03141 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mark3Q03141 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mark3Q03141 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mark3Q03141 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mark3Q03141 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mark3Q03141 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mark3Q03141 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mark3Q03141 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mark3Q03141 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mark3Q03141 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mark3Q03141 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mark3Q03141 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mark3Q03141 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mark3Q03141 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mark3Q03141 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mark3Q03141 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mark3Q03141 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mark3Q03141 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mark3Q03141 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mark3Q03141 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mark3Q03141 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mark3Q03141 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mark3Q03141 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mark3Q03141 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mark3Q03141 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mark3Q03141 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mark3Q03141 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Mark3Q03141 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mark3Q03141 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mark3Q03141 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mark3Q03141 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mark3Q03141 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mark3Q03141 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mark3Q03141 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mark3Q03141 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mark3Q03141 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mark3Q03141 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mark3Q03141 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mark3Q03141 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mark3Q03141 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms