Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
NfiaQ02780 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
NfiaQ02780 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25,48■■□□□ 1,67
NfiaQ02780 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25,48■■□□□ 1,67
NfiaQ02780 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
NfiaQ02780 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
NfiaQ02780 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
NfiaQ02780 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
NfiaQ02780 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
NfiaQ02780 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
NfiaQ02780 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
NfiaQ02780 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25,45■■□□□ 1,66
NfiaQ02780 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,45■■□□□ 1,66
NfiaQ02780 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
NfiaQ02780 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
NfiaQ02780 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25,45■■□□□ 1,66
NfiaQ02780 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25,44■■□□□ 1,66
NfiaQ02780 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25,44■■□□□ 1,66
NfiaQ02780 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
NfiaQ02780 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
NfiaQ02780 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
NfiaQ02780 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25,43■■□□□ 1,66
NfiaQ02780 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
NfiaQ02780 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25,42■■□□□ 1,66
NfiaQ02780 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25,42■■□□□ 1,66
NfiaQ02780 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
NfiaQ02780 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
NfiaQ02780 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25,42■■□□□ 1,66
NfiaQ02780 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
NfiaQ02780 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25,41■■□□□ 1,66
NfiaQ02780 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
NfiaQ02780 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25,4■■□□□ 1,66
NfiaQ02780 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
NfiaQ02780 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
NfiaQ02780 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
NfiaQ02780 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
NfiaQ02780 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
NfiaQ02780 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25,38■■□□□ 1,65
NfiaQ02780 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25,38■■□□□ 1,65
NfiaQ02780 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
NfiaQ02780 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
NfiaQ02780 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
NfiaQ02780 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
NfiaQ02780 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
NfiaQ02780 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
NfiaQ02780 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
NfiaQ02780 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
NfiaQ02780 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
NfiaQ02780 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25,35■■□□□ 1,65
NfiaQ02780 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
NfiaQ02780 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
NfiaQ02780 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
NfiaQ02780 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
NfiaQ02780 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
NfiaQ02780 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
NfiaQ02780 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25,33■■□□□ 1,65
NfiaQ02780 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25,33■■□□□ 1,65
NfiaQ02780 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
NfiaQ02780 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
NfiaQ02780 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,32■■□□□ 1,64
NfiaQ02780 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
NfiaQ02780 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
NfiaQ02780 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
NfiaQ02780 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25,31■■□□□ 1,64
NfiaQ02780 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
NfiaQ02780 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
NfiaQ02780 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
NfiaQ02780 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
NfiaQ02780 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
NfiaQ02780 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
NfiaQ02780 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
NfiaQ02780 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
NfiaQ02780 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
NfiaQ02780 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
NfiaQ02780 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25,28■■□□□ 1,64
NfiaQ02780 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
NfiaQ02780 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
NfiaQ02780 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
NfiaQ02780 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
NfiaQ02780 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
NfiaQ02780 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
NfiaQ02780 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
NfiaQ02780 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
NfiaQ02780 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
NfiaQ02780 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25,26■■□□□ 1,63
NfiaQ02780 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
NfiaQ02780 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
NfiaQ02780 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,25■■□□□ 1,63
NfiaQ02780 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25,25■■□□□ 1,63
NfiaQ02780 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
NfiaQ02780 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25,25■■□□□ 1,63
NfiaQ02780 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
NfiaQ02780 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25,24■■□□□ 1,63
NfiaQ02780 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
NfiaQ02780 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
NfiaQ02780 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
NfiaQ02780 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25,23■■□□□ 1,63
NfiaQ02780 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,23■■□□□ 1,63
NfiaQ02780 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
NfiaQ02780 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50,1 ms