Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Muc1Q02496 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Muc1Q02496 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Muc1Q02496 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Muc1Q02496 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Muc1Q02496 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Muc1Q02496 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Muc1Q02496 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Muc1Q02496 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Muc1Q02496 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Muc1Q02496 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Muc1Q02496 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Muc1Q02496 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Muc1Q02496 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Muc1Q02496 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Muc1Q02496 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Muc1Q02496 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Muc1Q02496 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Muc1Q02496 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Muc1Q02496 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Muc1Q02496 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Muc1Q02496 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Muc1Q02496 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Muc1Q02496 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Muc1Q02496 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Muc1Q02496 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Muc1Q02496 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Muc1Q02496 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Muc1Q02496 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Muc1Q02496 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Muc1Q02496 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Muc1Q02496 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Muc1Q02496 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Muc1Q02496 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Muc1Q02496 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Muc1Q02496 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Muc1Q02496 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Muc1Q02496 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Muc1Q02496 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Muc1Q02496 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Muc1Q02496 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Muc1Q02496 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Muc1Q02496 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Muc1Q02496 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Muc1Q02496 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Muc1Q02496 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Muc1Q02496 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Muc1Q02496 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Muc1Q02496 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Muc1Q02496 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Muc1Q02496 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Muc1Q02496 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Muc1Q02496 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Muc1Q02496 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Muc1Q02496 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Muc1Q02496 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Muc1Q02496 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Muc1Q02496 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Muc1Q02496 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Muc1Q02496 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Muc1Q02496 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Muc1Q02496 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Muc1Q02496 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Muc1Q02496 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Muc1Q02496 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Muc1Q02496 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Muc1Q02496 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Muc1Q02496 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Muc1Q02496 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Muc1Q02496 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Muc1Q02496 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms