Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd1Q01822 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1Q01822 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1Q01822 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1Q01822 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1Q01822 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1Q01822 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1Q01822 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1Q01822 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd1Q01822 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd1Q01822 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd1Q01822 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd1Q01822 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1Q01822 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1Q01822 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1Q01822 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1Q01822 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd1Q01822 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd1Q01822 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd1Q01822 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd1Q01822 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd1Q01822 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd1Q01822 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd1Q01822 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd1Q01822 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd1Q01822 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd1Q01822 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd1Q01822 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxd1Q01822 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd1Q01822 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms